盤古開天闢地以後，女媧造人，人類刀耕火種，漸至繁榮。但在此過程中，人類中兩個最大的部族卻因相互的仇怨，連年征戰不休，天塌地陷，雙方死戰不休，女媧於心不忍，斬鰲補天。後因補天力竭身死，遂自斷神器愚下木，將九州分為兩界，各置二族於其中，並留下箴言：愚下木重鑄之時，便是兩界合二為一之日。為愚下木不至丟失，存於只有兩瓣的蓮花之中。女媧本意，在於兩族終能止戰止殺，和平共處。卻不料適得其反，兩族互相忌憚對方愚下木之威力，互相搶奪，愈演愈烈，人魔兩族由此而生。

穆天然和勺子在山洞中識破原來一切是大虎幾人佈置的陷阱，將計就計，順勢教訓了大虎幾人，但與勺子不小心觸碰了山洞中的機關，掉進了深洞中。楊仁執斬殺靈蟒精之時，一隻大白貓出現救了靈蟒精，兩人鎩羽而歸，凌兮的靈寵“靈蜥”亦被靈蟒精吃掉。二人在樹林裡走著互相埋怨之際，意間聽見了貓妖的聲音，二人前去探查意外發現貓妖和靈蟒精的行跡。原來靈蟒精與貓妖有多年聯繫，貓妖為清算二人亂帳，自己糾纏在楊仁執和凌兮二人中間。在楊仁執和凌兮爭吵時，靈蟒精已逃走，凌兮憤怒將貓妖打暈。貓妖早已逃開，躲在樹上嘲諷二人，並將靈蜥的屍體扔給凌兮。

福祿村眾人尋找穆天然，村長找到了他，語重心長的囑咐穆天然，讓他去長安的路上、在日後的生活中要小心，穆天然不願離去，被村長叫來的壯漢強行架走。穆天然剛走，天嵐海閣的人就趕到，先予來者不善，村長打著馬虎眼，先予卻不管三七二十一直接下狠手對待魔族村民，村長此時為了村民安危不得不正面應付先予。村長和眾人已經決定面對未知的結局，唯一擔心的便是天然回來。

穆天然和勺子在街上遇到了異國商人，買了他手中的貨物，花光了所有的盤纏，結果他二人換上異國服飾卻被攔住不讓進城。先予以為楊司伯要懲罰自己，卻發現楊司伯使出法力拿出了兩瓣蓮花，並且告訴他自己對她的期望，同時將兩瓣蓮花給她，讓她尋找愚下木的蹤跡。三千年前，女媧為愚下木不至丟失，將它存於只有兩瓣的蓮花之中，若愚下木有蹤跡顯形，蓮花便可昭示徵兆。同時，楊司伯的傷勢復發。最終，先予帶著太陰旗的除魔師出城尋找愚下木的蹤跡。

楊仁執告訴他們他的親生父親就是此任除魔真君楊司仲，穆天然和楊仁執結拜為兄弟。楊仁執察覺到靈蟒精潛伏在宮城之中，穆天然看見放煙花十分感興趣，楊仁執邀請他去宮城看煙花，製造混亂掩護楊仁執捉妖。楊仁執掩護穆天然成功混入了放煙花的隊伍，淩兮也用水魚找到了靈蟒精的下落，卻又一次被美食吸引。水魚來到了靈蟒精面前卻找不到凌兮十分著急，被小太監用酒罈蓋了起來，凌兮也因為偷吃食物被禁軍綁到了皇上面前，凌兮看見了靈蟒精，化水凝劍，二人打鬥起來，靈蟒精趁亂逃脫，走前毒暈了殿上的皇親國戚，凌兮見狀追了上去。

魔界中煉山與一神秘人交談，鼓勵此人前去尋找愚下木，同時交給了她黑色蓮花，給了她三天時間，讓她去人界尋找愚下木的蹤跡。凌兮回到了大殿內，用玉淨瓶救了殿上的皇族們，火勢燒了過來，凌兮救火，皇族感謝不已，皇上將其封為濟世聖姑，凌兮卻並不買帳，接過玉牌就走，皇上在凌兮走後要求禁軍捉拿縱火之人，整飭禁軍。穆天然和勺子在街上躲避官兵追捕，幫助一名百姓毆打官兵，誰知百姓竟恩將仇報大聲呼喊逃犯在此，穆天然和勺子只得抱頭流竄。

楊仁執在一旁觀看，設計拿到了凌兮的金牌，同時讓她吃下了有符印的鴨子，帶著她一同回秦州城。楊仁執帶著穆天然和勺子運用法術跑到了百里之外，沒想到莊先生還是追了上來，執意帶走穆天然，楊仁執出手阻攔不敵莊先生而受傷，穆天然為了保護同意和莊先生走，楊仁執仍舊不讓穆天然離去，莊先生詫異於穆天然和一個除魔師結拜，最終放過了穆天然，表示從此以後，他們二人再無瓜葛。楊仁執傷重昏厥，凌兮忍不住出手為他療傷。楊仁執醒來後告訴凌兮他只是想讓她去天嵐海閣解釋一下她的衣服和法術從何而來，別無他意，同時去掉了凌兮身上的符咒。

萬妖之王甲申因護不住妖們難過不已，讓手下去找兩名義弟。與此同時，魔族神秘人偷襲先予拿走了白蓮花，迫使先予和她達成協議。穆天然向勺子炫耀方既白給他的鈴鐺，勺子卻十分反感，而凌兮和楊仁執還在生彼此的氣。凌兮把穆天然綁了起來，和楊仁執達成和解，與三人一同前往秦州城，那晚的事就當做沒發生過。楊司伯傷勢發作，先予回到了秦州城告訴了他擒獲魔族一事，楊司伯前去查看，神秘人發現愚下木就在楊司伯身上。楊司伯出去發現先予和宿百朽劍拔弩張，將二人斥責一番。

楊司仲回到了天嵐海閣，告訴了楊司伯幾人凌兮之事，得知凌兮是楊司仲徒弟陸冰的徒兒，幾人決定讓她加入天嵐海閣，直接進入楊司仲的正陽旗，同時開始準備考核一事，但凌兮選擇參加考核來歷練自己的法術。楊仁執和穆天然也趕到，想要參加考核，楊司伯應允。穆天然幾人退下後，楊司仲告訴其他人他不會再參與人魔對抗之事,一心只想培養楊仁執成才。穆天然詫異楊司仲的樣貌如同村長爺爺一般，凌兮解釋其受了魔族的傷，並詢問二人為何也要參加考核，楊仁執告訴凌兮二人欲參加考核的真正目的是進入最後一關鎖妖窟營救勺子。此時，楊仁執向凌兮求助，希望其可以助二人一臂之力。

穆天然在報名現場遇到了鷹隼，二人一言不合就要開打，楊仁執站了出來，鷹隼暴起傷人卻被楊司仲阻攔，鷹隼只得離去。同時，他們還在此處遇到了張不煩和蘇子墨。楊司伯利用水鏡監視著楊司仲的一舉一動。楊仁執回到家中和父親因為之前的事產生了矛盾，吵了一架，不歡而散。楊仁執心煩去找穆天然談心，二人一起過生辰、回家看見父親兩人談話平和了許多。楊仁執回到房間看到父親準備的飯菜和新衣衫，不禁感動。

楊仁執畫出了考題中植物的形狀，發現是烏株之心烏株。蘇子墨和張不煩也通過了測試，同時也發現了迷宮的出路。而鷹隼直接搶過了其他人的試卷，脅迫別人帶他出迷宮。因為出題的事情，先予和宿百朽矛盾激化。穆天然、楊仁執和凌兮在迷宮中走著，穆天然無意間碰到了機關，放出了一隻火虎，凌兮使用法術將其澆滅，眾人鬆了口氣之時火勢更盛，楊仁執和凌兮使用法術想要衝出重圍，此時開明獸衝出穆天然體內，眾人都沒法抵擋，渡風及時趕到，制服了開明獸，並將穆天然帶到楊司仲幾人面前。楊仁執和凌兮趕至，告知東考場已經大亂，考核已經停止。

眾考生到達了高塔，楊司仲為考生出最後一關測試的考題，在地上種下了蒲公英，隨後離去。穆天然覺得蒲公英生長有趣跑過去和楊司仲搭訕，楊仁執覺得要避嫌想拉走穆天然，楊司仲卻留下了意味深長的話。穆天然和楊仁執回到了人群中，凌兮和楊仁執因為剛才的事產生了矛盾，雙方間隙更深。考試開始，楊司仲讓考生們手持蒲公英登頂高塔，楊仁執和穆天然正在尋找凌兮決定一同考試，凌兮卻視他們如空氣徑直上前，獨自面對測驗。

下層妖怪們的三個老大雷英、風眠、雪怒盛情款待凌兮、穆天然和勺子三人，三人盛情難卻，正準備勉強吃下了他們做的宴席，凌兮卻注意到了小妖和雷英的眼神交流，提醒其他二人小心。楊司伯見時辰已到，將蘇子墨等人帶出，宣佈考試正式結束，擇日即將進行正式的入門儀式並分配眾人到各自的旗主手下。楊司伯發現少了穆天然和凌兮兩人，大感意外，便詢問蘇子墨，蘇子墨不善撒謊，雖聲稱不知，但楊司伯一眼便看出內有緣故，雖然心中擔憂二人打探出自己吸食妖靈的秘密，但還是故作鎮靜，表示二人看來是沒能熬過這最後一關，大歎可惜。蘇子墨心懷僥倖，便也不再多言。

楊司伯與先予進入鎖妖窟，遍尋之後發現根本沒有穆天然凌兮的蹤跡，心中疑惑，質問被綁眾妖精，也皆是不知，先予稱也許是此二人膽小怕事，壓根就沒進入其中，楊司伯心中不解，但也無可奈何，只好加強鎖妖窟封印後與先予離去。而先予和楊司伯的一系列行為，皆被隱藏在暗處的莊先生看得一清二楚。眾妖看到穆天然所帶鈴鐺，言稱自己兄弟三個都是昔日方既白的部下，得知穆天然曾與方既白結交，立時將穆天然奉為大哥。

凌兮前來詢問楊司仲為何不按承諾讓其入正陽旗，二人許下約定，若凌兮可以殺一千隻妖並且打敗楊司仲，便將除魔真君的位置讓個凌兮。楊司伯派先予打探穆天然與楊司仲的舉動，先予找到落選的鷹隼，破例允許他加入天嵐海閣自己旗下並打探穆天然和凌兮的消息。先予欣賞鷹隼的陰狠毒辣，提出收他為徒。蘇子墨和張不煩商討在鎖妖窟見到的詭異的事物，對穆天然和凌兮安然出來表示詫異，為了消除楊仁執、穆天然和凌兮對他們的懷疑，蘇子墨提議前往慰問穆天然。

除魔真君鍾馗性格耿直，在天庭得罪不少人，遭天庭貶謫，落入凡間，化身為少年穆天然，喪失記憶和法力。在找尋身份的過程中，偶然結識楊仁執、凌兮等人，並結為莫逆之交。一行人斬妖除魔，鋤強扶弱，守護世間。雖然法力全失，但保有善良與正義的鍾馗，依舊憑藉聰明與變通，屢屢化險為夷。在此過程中，眾人被捲進一個驚天陰謀。陰謀的始作俑者，竟是鍾馗好兄弟楊仁執的伯父、人間第一仙師楊司伯，楊司伯為了一己之欲，造成人間動盪。為此，鍾馗和楊仁執反目成仇，各自踏上不同的道路，尋得各自的歸宿。在經歷種種考驗後，鍾馗終於再次獲得位列仙班的資格。然而，本可抽身而去的他，卻為世間永保和平，選擇繼續拯救亂局。經歷諸多磨難與犧牲後，鍾馗靠著智慧與信念，終於粉碎楊司伯的陰謀，守衛人間安寧，成為名符其實的除魔真君。

鷹隼設計使眾人收到妖族的圍攻，穆天然使用方既白所贈鈴鐺擊退眾妖，在打鬥中鷹隼受傷，得到穆天然的改觀。鷹隼一路上盡力的在對穆天然等人示好，凌兮和楊仁執很是莫名其妙且並不買帳，但穆天然卻沒見過此等陣勢，慢慢跟鷹隼有說有笑起來。鷹隼趁機詢問穆天然來自何處，穆天然自是直言不諱，但楊仁執和凌兮卻趕緊攔住，要穆天然謹言慎行。一路上，鷹隼忙著跟穆天然建立友誼，而同時的，凌兮與楊仁執的情感也在多日來的朝夕相處中漸漸升溫，凌兮內心中冰冷的部分漸漸被楊仁執溫潤如水的性格所化解，但她依舊以一個強硬的形象示人，不願將內心中的真情實感暴露出來，只因她明白自己命不久矣，只需縱情於山水美食，談情說愛這種事情並不是她能擁有的生活。

穆天然瞭解到自己的身世使命，忽然間有了一種莫名的使命感，這種使命感讓他有些不知所措，在石英石膽的提議下，穆天然在前往墮仙石的路上再一次溜出跑到鎮上，跟人族“學習”如何成為一名領袖。待到石坤反應過來時，穆天然與石英石膽兩兄弟已經回到營地，穆天然告知石坤自己要打響名聲，從此號稱天地聖明神武大將軍，只要完成三個目標，一定會能救魔族於水火之中。石坤哭笑不得，因為穆天然所謂的“學習”都是來源於天橋底下說書人，而被穆天然奉為聖經的只是說書人講述的三國志。

莊先生現身幫助楊仁執尋找穆天然。鷹隼帶領先予與天嵐海閣除魔師趕到，先予聽聞穆天然被帶走後立刻率領弟子將石坤等人圍住，但魔族人數雖少，但實力依然強大，除魔師們隨用封印將眾人困住但也並無他法。但即便如此，石坤深知僅憑自己手下這些人遲早會被先予捕殺，就在危難時刻，方既白居然意外的出現在封印之內，穆天然驚喜，求方既白帶自己和石坤等人出去。方既白應允，但也提出條件說自己沒去魔界玩過，要穆天然帶他一同去玩一遭，穆天然一口答應。於是在方既白的安排下，穆天然一眾溜出除魔師封印，前往魔界。

石坤向月嵐解釋穆天然失蹤的原因，月嵐下令無論如何要將穆天然找回來。月嵐憤怒之下鞭打罌粟。十七前去控火，穆天然陪同。穆天然現在所在之處名為“岩城”，是魔界中的唯一城市。岩城是一座由巨大地下山體所建、圓環柱體的巨大建築建築，厚厚的岩壁上開鑿出了無數洞穴當做居民住所。城市的中央，聳立著一顆巨樹。枝椏向上生長，猶如一隻試圖擭住天空的巨掌，手掌中央則漂浮著一顆巨大的火球。街道上，數量眾多的魔族來往穿梭，往返於巨樹和街道之間。他們雙手合攏捧在胸前，其中透出微微火光，這棵燃燒的樹名為烏株之心，是岩城存在的根基。

石坤向莊先生求教迎回魔族王首後該如何行事，莊先生認為穆天然的回歸必定對魔族現在的局勢造成衝擊，讓其耐心等待，坐山觀虎鬥，並讓其保護好穆天然。月嵐命罌粟為穆天然獻舞。石坤向穆天然一一介紹了宴會眾人的身份及性格。罌粟由於獻舞過程中出錯被禮光變為蚩尤骨，被穆天然挺身攬下，煉山亦幫忙。黎光承認穆天然的身份，但是條件是要穆天然帶領魔族走出困境，替魔族報仇雪恨。穆天然和黎光在對人魔相處方式上產生了分歧。此時，棄世者闖進宴會，穆天然與煉山成功擊退棄世者。穆天然由於勞損過度，元氣大傷而暈倒。

楊仁執和凌兮在私塾遇到一班頑皮的學生，凌兮出手懲罰他們，楊仁執心軟。楊仁執為凌兮折了一隻紙鶴，並訴說了折紙鶴的緣由，只要折夠一千隻，父親就會回來。楊仁執和凌兮為學生做飯，凌兮教授楊仁執廚藝，二人感情升溫。穆天然和罌粟在集市上收到群眾的圍攻，此時，煉山出手解圍，並說出穆天然王首的身份，眾人參拜。穆天然暈倒，月嵐用烏珠為其療傷，石坤承諾會用法力幫助穆天然渡過難關。魔界冰火交界處，棄世者們漸漸聚集，媛媛看著岩城冒出的紅色光芒。月嵐給石坤三日時間，不然將喂穆天然食下靈珠。受到挑唆的魔族人前來王庭找穆天然討說法，石坤為阻攔而受傷。

天嵐海閣內，鷹隼與張不煩爭吵被楊司仲撞破，將其二人與蘇子墨帶到先予面前。楊司仲向先予討要蘇子墨和張不煩。石膽和石英去穆天然房間偷靈珠，被穆天然發現，對其二人出手。穆天然性情大變，差點錯手殺了石膽，被罌粟及時制止。罌粟告訴煉山月嵐已經開始起疑心，煉山準備除掉石坤。楊司仲讓蘇子墨和張不煩查閱一切關於萬妖山的資訊，二人欣然接受。穆天然回憶對石膽石英出手的情景，他時常頭痛難忍，也越來越難以克制情緒，常常莫名發怒，拒絕食用靈珠，煉山還是以花言巧語騙的穆天然食下靈珠。

月嵐和黎光得到消息趕來角鬥場救下穆天然。月嵐查看穆天然的身體情況，深知他受到靈珠的侵蝕，已經沒救了。月嵐欲將罌粟嫁給穆天然，希望能穆天然在死前留下子嗣，說到底，穆天然只是這幫人的棋子罷了。他們想要的，無非是愚下木，以及穆天然身上的“王首血脈”，給自己的奪權找一個正統的理由。穆天然發作，罌粟深感愧疚。罌粟回到牢中發現石坤的屍體不見了。石膽和石英將石坤救走試圖救他，但無果。罌粟找到他們，並為石坤療傷。月嵐以靈珠威脅穆天然娶罌粟為妻，穆天然欣然同意。

先予向甲申傳信，楊司仲帶領人馬來鏟平萬妖山莊。魔界境內，三位長老帶領魔族眾人抵抗棄世者，煉山無奈只好撤退，並下令繼續尋找穆天然和罌粟。罌粟用法力為穆天然療傷，驚訝於穆天然服用靈珠的劑量如此之大。月嵐欲眾長老在大殿商討對敵對策。萬妖山莊，莊先生獻身，為甲申獻策對抗天嵐海閣。穆天然和罌粟來到岩城之外，岩城之外酷寒無比，漸漸的，罌粟失去了知覺。等罌粟再次醒轉，卻發現自己並沒有死。穆天然始終還是狠不下心把罌粟拋下等死，去而複返，將昏迷的她裹在懷中取暖，罌粟被打動，她在不知不覺中對穆天然產生了好感。歷經磨難，兩人終於等來的救援。

穆天然跑到烏株之心，月嵐趕到，穆天然告訴月嵐要在臨死前為魔族作出貢獻，縱身躍入了烏株之心之中。煉山趕到烏株之心回憶起自己大哥郁壘躍入烏株之心的情景。不知過了多久，穆天然悠悠醒來。他身處之地與魔界截然不同：天空色彩斑斕變幻；腳下是一望無際的草地，目所能及的極限處，有一顆參天巨木。這裡景色優美，比魔界好了不知多少倍，卻處處透出一絲詭異的氣息。穆天然以為已經到了陰間，四處尋找閻王在哪裡。走了不知多久，穆天然來到了巨樹之下，在那裡發現了一位正在打坐的老者。郁壘認出穆天然是穆子陵的兒子。穆天然向郁壘訴說煉山的所作所為。

穆天然回到王庭死而復生。楊仁執通過莊先生和甲申得知了天嵐海閣居然和萬妖山莊竟有關係，同時，莊先生要楊仁執慢慢的看清這個世間。罌粟、方既白、勺子等人被煉山抓住。穆天然帶著郁壘前去救人。煉山之所以反叛，除了同情下等魔族之外，還有個重要原因——無法對兄長的死釋懷。在煉山看來，郁壘一直忠於魔族，最後卻淪為替罪羔羊白白犧牲。穆天然很欣賞煉山。但想要將他收歸己用，就必須先解開他的心結。穆天然將郁壘帶了出來。煉山沒有想到兄長尚在，驚喜之余，在穆天然的勸誡下最終歸順。穆天然並沒有處置煉山，而是讓他帶領棄誓者保護蚩尤骨運送火種，直到自己找回愚下木。

穆天然單槍匹馬闖入宿百朽營帳，提出不損一兵一卒，以下棋定勝負，棋癡宿百朽一口答應。穆天然使出自己福祿城五子棋之王的絕招，決勝宿百朽，宿百朽無奈讓路，班師回閣。凌兮在書中看到桂靈這味藥有起死回生之功效，只是極其珍惜，難以尋覓。凌兮與蘇子墨兩人翻遍秦州城也未找到，正在沮喪之時，偶遇灼鴨王常貴的新店開張。兩人饑腸轆轆，決定先去飽餐一頓。常貴對當年在長安被方既白擺了一道耿耿於懷，要求再與凌兮比試一番。凌兮行雲流水的廚藝讓常貴心服口服，雙方誤會解除，成了朋友。常貴無意間透露出桂靈的下落，凌兮與蘇子墨欣喜萬分，當即動身尋找。

楊司伯約見穆天然父子相認，穆天然欣喜又疑惑，楊司伯叮囑要保密兩人的關係。穆天然建議既然是一家人，不如將閣中愚下木先借我一用。楊司伯表示此事公開難以服眾，但可以私下取走，同時要求穆天然交出黑蓮花以表誠意。穆天然一口答應，開心離去後，黑蓮花竟在暗香閣中亮了起來。楊司伯大擺筵席，宣佈要人魔結盟，和平共處。穆天然看到他的領袖風采十分佩服，決心向爹爹學習。席間一場穆天然欽點的《白蛇傳》本是喜劇，勺子卻悲傷得幾近昏厥，感到做妖萬般好，不如做人愛一場。

凌兮把他關進楊仁執的房間。兩人在屋裡鬥法，被蘇子墨撞見誤會。穆天然趁機逃跑，直奔鎖妖窟而去，凌兮隨後跟進。蘇子墨嫉妒楊仁執在病中仍對凌兮關心不已，決定報信先予。方既白和勺子偶遇算命先生，於是求籤，兩次抽到下下簽，勺子負氣離開。石坤蒙面潛入楊司伯房間，調查愚下木線索，卻被楊仁執撞了個正著。打鬥中，石坤手臂中了石化符咒，無奈之下打暈楊仁執。求籤算命歸來的方既白和勺子發現暈倒的楊仁執，剛剛將其帶回天嵐海閣，就被除魔師綁了。

穆天然懊惱自己辦砸了事，又懷疑楊司伯是否以父為名欺騙了自己，郁壘不置可否。一番商議後，穆天然決定先去福祿村安定下來。與此同時，方既白與勺子卻在夜裡被不明人物綁架失蹤。先予急回暗香閣稟報，見到楊司伯方知是計。楊司伯命先予以愚下木失竊之罪，帶兵追擊穆天然，楊仁執得知後，請命同去。出發前夜，借楊司伯療傷之際，莊先生出現摧毀了黑色蓮花。楊司伯懷疑有內鬼，先予更發現莊先生接近時，黑蓮花似乎亮起。楊仁執帶隊出發，路上屢屢與先予意見不合，並處罰了鷹隼，先予恨意漸生。

穆天然代筆傳書，並告知楊仁執愚下木是假的。楊仁執得知二人平安放心下來，認定與自己纏鬥的人才是真凶。蘇子墨以為傳書是凌兮所寫，十分眼紅。楊仁執準備與穆天然會和，藉故和先予兵分兩路。蘇子墨執意跟隨，故意引錯方向。先予通過黎光線索得知穆天然下落，帶人圍堵，穆天然已早一步帶大多數村民離開。先予用酷刑審問留下的馬哥，楊仁執及時趕到，為救人出手傷了先予。事後楊仁執向先予道歉，卻無意間透露自己在萬妖山莊見到先予威脅甲申，先予以為楊司伯吸食妖元之事暴露，起了殺心。

在先予的設計下蘇子墨身份敗露，情急之下露出魔族特徵，被鷹隼引到此處的楊仁執遠遠看到，蘇子墨奪路而逃。楊仁執一路追尋魔族蹤跡至山頂，被一夥黑衣人圍攻。楊仁執掙扎時扯掉一黑衣人面罩，發現竟是鷹隼，楊仁執落崖。楊司伯與楊司仲得知此事大驚，傳命先予全力尋找。蘇子墨認為是自己的責任，傷心欲絕。莊先生趕到大營，通過鷹隼的傷勢懷疑此事是先予授意為之。出走的罌粟遇到山崖下的楊仁執，見是天嵐海閣弟子打扮，為打聽穆天然的消息救了他。但一番介紹後，竟發現一個是兄弟，一個是嫂夫人。罌粟為早日取得愚下木，說服楊仁執回秦州城向楊司伯訴說遭遇，並得知打傷石坤的正是眼前這個人。

途經大旱村，罌粟在長樂坊贏了許多錢，賭徒惱羞成怒之時，楊仁執救下罌粟。楊仁執正要責怪罌粟賭博，卻得知她只是為了救助小乞丐。賭徒暗中報復，楊仁執新舊傷夾雜，病倒。穆天然召開福祿村命名大會，投票後決定更名為福祿城，之後又決定自由圈地建城。胡青青聽聞方既白竟然與別人生子，也來到福祿城。全城男女老少為圈地忙得不亦樂乎。方既白也為勺子圈了一塊，胡青青見狀故意逗他。勺子匆匆趕來宣佈自己決定變人，胡青青私下問方既白萬一勺子想起前世的事怎麼辦。方既白表示自己欠勺子的，無論如何得還她。

蘇子墨發現先予的陰謀，決定放走凌兮，兩人前去營救。楊仁執被先予從客棧中帶出，正遇到罌粟與及時趕到的凌兮、蘇子墨。先予決意清理門戶，幾人身陷險境。莊先生趕來重傷先予，先予也給了楊仁執致命一擊，逃走前帶走了十七。先予逃回天嵐海閣稟告楊司伯，楊仁執是被魔族所殺。謊言被蘇子墨拆穿，楊司伯大怒，警告先予守口如瓶，下不為例。聽到楊司伯編造楊仁執死因的謊言，楊司仲徹底失望。通過莊先生的法陣，罌粟與凌兮將昏迷的楊仁執帶回福祿城。凌兮留下照料楊仁執，穆天然帶罌粟來到精心佈置的新房，罌粟心中甜蜜，卻仍不肯給穆天然好臉色。

穆天然為楊仁執準備的大禮是一方熱氣騰騰的人工溫泉，為的是重溫幾人情誼的伊始：凌兮洗澡的那一幕。楊仁執哭笑不得，被穆天然強拉到水邊，沒想來沐浴的卻是一心要洗去妖氣的勺子。蘇子墨苦苦哀求釋放十七，楊司伯不置可否。蘇子墨心懷怨恨，答應幫莊先生除掉楊司伯。楊司仲設計讓楊司伯在眾人面前暴露吸食妖元的秘密，不料先予卻將罪名獨自扛下。楊司伯明知是楊司仲所謂，卻毫無證據，只得舍車保帥，先予含笑死在楊司伯手下。黎光將天嵐海閣發兵福祿城之事告訴黎武與黎弼，三人決定在魔界製造一番動亂，與楊司伯裡應外合。

穆天然獨闖天嵐海閣大營面見楊司伯，怒斥他用假愚下木欺騙自己，楊司伯狡辯，意欲誣陷莊先生。莊先生卻忽然現身，楊司伯惱羞成怒大打出手，莊先生帶穆天然逃走。楊仁執來遲一步，被楊司伯軟硬兼施留在營中。留在城中的人開始佈防，準備迎敵。罌粟卻發現楊司伯在福祿城上空布下結界，意欲以全城人的性命逼迫莊先生現身。莊先生叮囑穆天然儘快帶眾人離開，穆天然卻轉身打暈了他。穆天然假扮莊先生卻與楊司伯周旋，未想到楊仁執也扮成莊先生現身。兩個人很快穿幫被打暈，楊司伯大怒，發動法陣，福祿城開始不斷上升。

石英以自己全部的精魄救活罌粟，罌粟醒來後痛不欲生。逃生路上，福祿城後山岌岌可危，穆天然用一己之力施法遏制，罌粟與凌兮堅決不離不棄，方既白與勺子也半路趕回。石坤推開穆天然撐住巨石，告訴幾人與其在這裡講義氣，不如去做更重要的事情，畢竟死比生容易。眾人與石坤訣別，努力逃離福祿城。楊司仲見穆天然三人危困，猛地用手杖遁地，手杖褪去層層粗糙的外皮，內中竟是愚下木杖首。楊司仲發動愚下木，一時間天昏地暗，風起雲湧。法陣頃刻間煙消雲散，福祿城也隨之四分五裂。空中逐漸形成巨大漩渦，穆天然等三人被捲入其中。

穆天然因為找到母親欣喜若狂，一路跟隨穆子陵回到魔族大營。深夜穆子陵偷偷摸摸想要離開，被石坤阻攔。穆天然得知穆子陵可能去見自己的父親，連忙央求罌粟出面幫她逃走。穆子陵脫身後告訴罌粟，自己要去成親。楊司仲氣力用盡，鬚髮皆白，回到家中靜養。楊司伯找愚下木無果，聽到宿百朽說楊司仲氣血兩虛，見客都隔著紗簾，心中起疑，派鷹隼去楊府偷藥渣。穆天然三人跟隨穆子陵到天嵐海閣大營，發現已是處處設防。三人躲過除魔師守衛，匆匆向山頂趕去。愚下木杖首現世驚動天地妖魔四界，各方勢力蠢蠢欲動。太白金星申請下凡，九黎派出死士去往人間，甲申也再次尋找方既白。

楊司伯計畫被破壞，惱羞成怒，狠心當著蘇子墨的面，設計讓楊仁執除掉了十七。蘇子墨向楊仁執坦誠了自己的身世與楊司伯的詭計，楊仁執震驚不已，找到楊司伯質問真相。楊司伯仍閃爍其詞，楊仁執忍無可忍，請命前往福祿城。楊司仲得知兒子的決定，加緊實行除掉楊司伯的計畫。穆天然三人在墮仙石附近找到重傷的穆子陵，一行人遭到除魔師大軍圍剿，危難關頭，楊司仲出現救下一行人。穆子陵生命垂危，楊司仲竟用自己的精魄為穆子陵續命，但仍是杯水車薪。穆天然心疼重傷的母親，但又苦於泊散界的規定無法相認，只得以朋友的身份盡力待她好。穆子陵十分感動，兩人的感情日益篤深。

泊散界中，傷重的穆子陵在穆天然三人的保護下返回魔界，路上卻遭楊司伯大兵壓境，楊司仲阻攔不及，穆子陵再度受傷。穆子陵拼死用自己的元靈加之楊司仲的鮮血造出一個孩子，並將孩子起名穆天然。穆子陵將愚下木託付給楊司仲，求楊司仲一定將杖尾送回魔界。穆天然三人知道楊司伯真面目和莊先生的真實身份，悲喜交加。當穆天然觸碰到孩子身體的時候，三人被彈出了時空幻境，回到福祿城。廢墟中穆天然三人遇到石膽，得知了這段時間發生的事情，石膽痛斥楊仁執背信棄義，城中倖存的村民們欲重建新城，以利再戰。

一番周旋後，甲申答應放走穆天然一行人，還願意提供直達長安的地下密道，但條件是讓穆天然當岫山隱會的女婿。穆天然和罌粟決定暫時犧牲石膽，讓石膽扮作穆天然去成親。婚禮當晚，穆天然、罌粟、凌兮三人有驚無險進入密道順利逃脫。另一邊，接到楊司伯命令的楊仁執到達長安城外，與楊司伯匯合，進入長安城。方既白和勺子也通過靈蟒精的幫助安全進宮。同時，莊先生夜會甲申，要求甲申阻止穆天然進宮，甲申答應在密道口截住穆天然幾人。穆天然三人在密道內遇見一醉酒糟老頭，因為老頭胡鬧，穆天然將密道撞開了一個大洞，另一邊連接的竟是長安的下水道。

老頭的辦法竟是通過太監宮女選拔入宮，凌兮、罌粟輕鬆入選，穆天然有驚無險的通過了淨身。原來，老頭竟是太白金星，此次是專門來幫助穆天然的。獨自在御花園的皇帝遇到，誤會了楊仁執和蘇子墨的關係，黯然離去的凌兮，好奇之下跟了過去。皇帝在凌兮與罌粟、穆天然碰頭時現身，引來宮中侍衛，情急之下，穆天然將皇帝綁到了太極殿。太極殿中，罌粟挑撥皇帝與天嵐海閣的關係，並表示希望與皇帝合作，同時以與凌兮深入認識誘惑皇帝。楊丁進殿搜查，皇帝出面強行保下了穆天然三人。在幾人以為已經安全之時，楊仁執出現在了他們面前，表明心意，與穆天然冰釋前嫌。

穆天然讓罌粟假扮凌兮與皇帝相會，兩人也因此相互表明了心意。罌粟化作凌兮與皇帝小船相會，趁機消解皇帝對魔族的偏見，卻被楊仁執看見，誤會了凌兮。蘇子墨終於明白楊仁執心意，傷心欲絕，恨凌兮入骨。穆天然與皇帝約定，皇帝將寢宮借穆天然一用，穆天然讓凌兮與皇帝再次約會。

凌兮與皇帝約會，被楊仁執看見，楊仁執追打穆天然之時，碰上了同樣扮成宮女太監的勺子與方既白。方既白告訴穆天然他準備和莊先生合作殺了楊司伯。楊仁執向凌兮解釋蘇子墨只是妹妹，並約其晚上於御花園相見。蘇子墨到御花園找凌兮，蘇子墨勸其放棄楊仁執，並且動了殺心，凌兮傷心離開，楊仁執趕到御花園卻沒有等到凌兮。穆天然將罌粟帶到皇帝寢宮，兩人感情升溫。另一邊，凌兮與楊仁執受到蘇子墨影響，再度決裂。

穆天然和楊司仲以詐死騙過人魔兩界。楊穆二人通力合作，穆天然回魔界調兵，楊仁執設法取得楊司伯的信任，並與方既白聯手打開了鎖妖窟。鎖妖窟被打開後，天嵐海閣一片混亂。宿百朽看在楊司仲的面子上在楊司伯面前，替楊仁執隱瞞了真相。魔界，黎光以為穆天然已死，散播穆天然死訊煽動叛亂。急需吸食妖怪元氣療傷的楊司伯，被蘇子墨用妖威脅，讓他將閣主之位傳給楊仁執，楊司伯依意傳位給楊仁執，遭到了宿百朽的反對。鷹隼向宿百朽表忠心，欲加害楊仁執，撩撥其與楊司伯的關係。

魔界，黎光率眾叛亂，穆天然即時趕到，裝神弄鬼終止了叛亂。凌兮再受折磨，楊仁執雖心痛不已，但無法阻止，罌粟為了凌兮不再受折磨，答應招供，要求見楊司伯，發現楊司伯已大不如前。同時，罌粟向鷹隼講述了楊司伯的秘密。穆天然將莊先生帶與郁壘長老見面，郁壘懷疑莊先生身份，在一番交涉後決定合作。穆天然拿黎弼開刀，激黎弼與自己賭能否修復烏株之心，乘機收了黎弼的兵符，準備攻打天嵐海閣，與元老會商議後改為挑選精兵強將，趁勢潛入天嵐海閣，暗殺楊司伯，再奪愚下木。凌兮連日遭到虐打，性命垂危，楊仁執不顧一切救了凌兮。另一邊，魔族已挑好精銳，準備出發，黎光要求同行。

楊仁執擔心蘇子墨反水，但方既白卻一口咬定她絕不會做對楊仁執不利的事。楊仁執祭拜十七遇見蘇子墨，質問蘇子墨那雷英和雪落與楊司伯之間有何交易。楊仁執為救蘇子墨錯手殺掉了原本準備用來當作誘餌的雷英，只好求助方既白臨時改變計畫，讓勺子充當誘餌。方既白反對，但勺子堅持，並要楊仁執承諾保護勺子安全。在蘇子墨的配合下，計畫成功，鷹隼身死，宿百朽被發配戍守墮仙堡三十年。楊仁執升太陰旗主，代閣主之位。楊司伯炎毒發作，楊仁執求了罌粟替他診治。罌粟用蠱暫緩傷情，讓楊司伯對蠱毒起了心思。成為代閣主的楊仁執再無阻礙，將凌兮從牢中接出。罌粟和楊仁執為凌兮療傷。

楊司伯讓蘇子墨引開楊仁執，由宿百朽去抓捕凌兮等人，凌兮擔憂楊仁執安危不肯離開，掩護方既白勺子逃脫，自己被抓。另一邊楊仁執也被擒回。楊司伯用凌兮威脅楊仁執，讓他向穆天然求援，但楊仁執卻讓穆天然速速離開。穆天然執意救人，楊司仲幫穆天然佈置，大隊人馬佯裝正面攻城，吸引注意力，穆天然楊司仲郁壘煉山四人，由楊司仲直接傳送到暗香閣外。營救計畫最終還是失敗，只搶出了罌粟一人，而郁壘也為了爭取傳送時間犧牲了自己，死前還讓穆天然小心內奸，並將矛頭指向黎光。

眾人逃出天嵐海閣後，楊司仲以自己為誘餌引開追兵。穆天然為郁壘的死向煉山請罪，同時兩人商議對付內奸的計策。天嵐海閣內，楊司伯當著楊仁執的面，逼凌兮吃下了劇毒的蠱蟲。穆天然故意讓黎光看見煉山逮到自己與罌粟假扮的楊司仲私會，讓黎光以為二人就此決裂。回到魔界後繼續演戲，讓黎光以為煉山要反。反目大戲越演越烈，煉山逼穆天然交出楊司仲，穆天然不肯，煉山便逼穆天然退位，隨後又有人刺殺穆天然，罌粟為救穆天然身受重傷命在旦夕，雙方展開了大戰。

黎光做著自己的王首夢，來到龕亥殿，見廝殺的人群竟全數消失，罌粟現身，才知自己中計。黎光為求自保擄走勺子，一路逃命，最後死在方既白手上。楊司伯接到黎光報信，魔族內亂，帶領除魔師大軍前往魔界，準備將魔族一網打盡。楊司伯以淩兮相逼，讓楊仁執帶領先頭部隊進入魔界。接到回報確認沒有危險後，才帶著淩兮與餘下人馬進入魔界。龕亥殿內，楊仁執與穆天然碰頭，以自己為表率命除魔師們放下武器。進入魔界後，楊司伯中了楊司仲設下的埋伏，沒想到竟束手就擒，淩兮終於被救。方既白將前塵往事告知了勺子，勺子以為方既白做的一切只是為了補償自己的前世，與方既白慪氣。

穆天然給方既白出主意，讓他裝死騙勺子，勺子果然中計答應嫁給方既白。楊司仲回憶與穆子陵的往事，感慨不已。大婚當夜，楊司伯打出法訣，喚醒了淩兮體內的毒蠱，淩兮神智被控制，但其他人並未察覺。控制的淩兮殺了楊司仲，搶走愚下木杖首，並將其交給了楊司伯。楊司伯借愚下木之力重生手臂，並突破結界。楊仁執找到楊司仲，全力救治但無果，回想父子間的往事，傷心不已。同時，在楊司仲身邊發現了紙鶴，懷疑楊司仲的死與淩兮有關，更是傷心欲絕。

楊司伯又將烏株之心毀壞要徹底滅絕魔族，但他自己也遭到了極為強烈的反噬。烏株之心被毀，魔界以烏株為中心快速冰封，穆天然帶領魔族舉族遷移到人界。皇上派軍隊來幫助穆天然。楊司伯在回天嵐海閣途中，一路肆意妄為吸食老百姓，視人命為草芥。楊司伯派遣宿百朽和凌兮前往常臨，剿滅魔族。到了常臨，宿百朽卻綁了凌兮，真心與魔族求和。眾人拿擁有愚下木的楊司伯毫無辦法，此時石膽卻拉穆天然見什麼土地公，此人是一上仙所化，他告訴穆天然他自己就是鍾馗。

穆天然將上仙帶回老巢，軟磨硬泡，上仙終於答應幫助穆天然。上仙帶穆天然罌粟去萬妖山莊尋找神女，神女能幫穆天然恢復法力，但代價是他將忘掉人間的一切，而人間的至親至愛也不會記得他。為了阻止楊司伯穆天然毅然選擇了恢復真身。淩兮對不斷出現的楊仁執的畫面向楊司伯求解。蘇子墨告訴楊仁執淩兮的蠱毒無解，楊仁執為救淩兮向蘇子墨下跪。蘇子墨因愛生恨騙楊仁執去取幾乎會讓他搭上命的材料救淩兮。恢復真身後，穆天然前往天嵐海閣途中，遇到了尋找材料的楊仁執，將他也搭上。

穆天然與楊仁執前去天嵐海閣，被凌兮阻攔。楊仁執與凌兮糾纏，穆天然與楊司伯展開大戰，千鈞一髮之際，神女帶領眾人破了秦州城的結界，斷了楊司伯的力量來源，穆天然終於勝過楊司伯。楊司伯發了瘋，催動愚下木毀了天嵐海閣。楊仁執重傷將死，彌留之際，凌兮掙脫了控制恢復了記憶。化身為鍾馗的穆天然，離去之前，為楊仁執渡元氣續命。回歸天庭的鍾馗，忘卻了凡間所有事，因毀掉了愚下木還升了官。凡間，人魔和解，一個世外小村，死去的夥伴們都復活了，和倖存下來的人過著幸福的生活。其中一個小孩，和穆天然一模一樣，那是穆天然與罌粟的孩子，只不過沒人記得孩子的父親是誰。