怪醫黑傑克21

第1話【醫師證照回來的日子】 一心想要逮捕黑傑克醫生的友引警部，在黑傑克替他兒子醫治好十分難治的獅面病後，也決心要幫黑傑克申請醫師執照，然而桀驁不馴的他看不慣醫師會那些醫生的嘴臉，再次放棄考執照的機會於是被抓進監牢裡，直到醫師會會長自己的兒子遭槍擊，來求黑傑克醫生動手術…

第2話【BJ與父親的重逢】 留在答錄機的一名男子的聲音，以及黑男這個名字讓黑傑克又想起兒時的回憶。當時他與母親一起遭遇到未爆彈的意外，黑傑克在接受本間丈太郎醫師奇蹟式的手術後撿回一條命，可是母親卻過世了，而他的父親竟然在此時狠心丟下他們母子，相隔21年後才出現要求黑傑克為他現在的妻子動整型手術，要把她變成這世上最美的女人…

第3話【悲傷的皮諾可】 黑傑克醫生從父親間影三那裡回來後，立刻就遭遇到未爆彈的意外，雖然警方並沒有挖到他的遺體但是種種跡象顯示黑傑克已經死了，皮諾可雖然不願意相信，但是老闆先前就受黑傑克所託要讓皮諾可被人收養，傷心的皮諾可也不得不接受這樣的命運…

第4話【北歐的黑色天使】 黑傑克為了調查在本間醫師醫院中發現的相片，和皮諾可來到北歐找克羅傑爾博士，沒想到克羅傑爾卻在兩個月前車禍變成植物人，而該院的迪文副理事長還要提供高額費用，請黑傑克假扮成院長公開為一個癌末的母親動手術…

第5話【機械手臂】 黑傑克和皮諾可這次來到修達因綜合醫院，拿著那張相片要問修達因博士21年前的事，以及他提到的關於"黑色計劃"的事，正巧在這裡遇到木實女醫師，並且因此為她的病患特里頓進行手術，讓他免於被切斷手臂裝上機械手臂的遺憾…

第6話【空中醫院】 黑傑克為了追知道黑色計劃的修達因博士，急著趕往英國，不料機場人員表示要再確認他的身份不能馬上讓他出境，結果就在此時黑傑克遇到曾經看過他動刀的西川醫師，這位女醫師表示可以帶黑傑克前往英國，並且是搭乘由白拍子醫師開發的空中醫院…

第7話【百億圓的生命約定】 黑傑克在中東的某個小國家，被一名醉漢指認為殺人兇手，刑警不分青紅皂白逮捕他還對他刑求。幸好一個在這裡偶遇的日本人蟻谷出面作證，把黑傑克從黑牢裡救出來，黑傑克想酬謝他蟻谷都不收，於是他們約定好如果蟻谷生病或受傷時黑傑克絕對會醫好他，沒想到後來蟻谷被那個神秘組織的殺手追殺…

第8話【65年後的清醒】 一名病患在65年前的礦坑爆炸事件中受傷，從此失去意識身體也無法動彈，但是神奇的是65年來他竟然沒有老化還保有少年的樣子，他的家屬原本打算放棄要請奇利柯醫師讓他往生，後來在西川醫師的努力下，要請黑傑克醫生為他動手術…

第9話【心臟的刻印】 在修達因博士的指引下，黑傑克帶著皮諾可為了找知道所有秘密的男子喬治博士來到紐約，沒想到在這裡遇到我的恩師本間醫師禁止我醫治的-謎樣的心臟病"本間血腫"的病患，不過同時那個秘密組織狙擊了黑傑克…

第10話【紐約的奇蹟】 黑傑克受到紅蜥蜴的槍擊，幸好母親的遺物項鍊的墜子救了他一命，隨後他決定要救比爾的母親凱薩琳女士，於是他先訂好一個最高級的人工心臟，沒想到他為凱薩琳女士動手術之後發現她原來就是人工心臟，而且是超科技的人工心臟…

第11話【神秘醫師的宿命】 在巴特院長的指引下黑傑克來到加拿大，尋找他要找的關鍵人物喬治博士，沒想到才剛找到喬治博士可能的住處就被一名女子以槍相對，原來她是喬治博士的女兒由莉，而她是為了預防哥哥奇利柯來讓父親安樂死，因為他們的父親喬治博士也罹患神秘的絕症Phoenix病(鳳凰病)…

第12話【極光的彼岸】 知道所有秘密的男子喬治博士，因為罹患無法醫治的絕症-Phoenix病(鳳凰病)氣絕身亡，黑傑克只好帶著皮諾可前往位於北極圈的研究室，想在那裡找出一些線索，沒想到紅蜥蜴為了爭一口氣追殺到這裡，最後竟然是黑傑克救了她一命…

第13話【皮諾可,回日本去!】 在紅蜥蜴告知的線索之下，黑傑克與皮諾可來到非洲要找一位庫瑪博士，因為他可能知道Phoenix病(鳳凰病)的秘密，不過沒想到一到加彭共和國他們被水患困住，幸好遇到寫樂父子才有地方住不過也因為這樣的機緣，黑傑克拜託寫樂父親帶皮諾可回日本…

第14話【恐怖的Phoenix病】 黑傑克醫生與皮諾可進入叢林後，遇到了瑪麗之後好不容易找到了克瑪醫生，克瑪醫生在得知黑傑克是間影三的兒子後，說出"黑色計劃"(noirproject)的事，隨後又在自己受傷後說出關於Phoenix病(鳳凰病)，以及恐怖病毒的真相…

第15話【BJ父親的真相】 黑傑克接到父親病危的通知急忙趕過去，迎接他的是父親的現任妻子，也是黑傑克為她動整容手術的蓮花，蓮花很恨黑傑克把自己整成和他母親一樣的臉派人殺他，幸好紅蜥蜴及時出現救了他，不過幕後黑手竟然派人緊接在後抓走黑傑克…

第16話【向毀滅挑戰】 黑傑克原本終於要帶皮諾可回日本，沒想到卻在機場被請到"空中醫院"上，原來是有個罹患Phoenix病(鳳凰病)的病患要黑傑克醫治而且委託人是蓮花，更讓人意外的是病患竟然是他的父親全滿德，然而更大的危機就要出現了

第17話【生命的尊嚴】 原本要到"空中醫院"醫治全滿德的黑傑克，以及皮諾可、白拍子、西川等人，沒想到卻因為在癌症放射線的照射下BOP病毒更加進化蔓延到皮諾可及西川身上，另一方面美國空軍基地為了怕病毒擴散竟然發射飛彈要讓"空中醫院"徹底消失…